9 nov. 2009 ... L'assistant(e) conduira des expériences en biologie, dans les domaines de la
biochimie des protéines (western blot, HPLC) et de la biologie ...
INRA-DRH | numconcours externes 2009
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AI | Assistant en techniques biologiques
profil n° : emploi-type n°:
Tours
AI09-PHASE-4 A3A23
concours :
AIA04
Lieu du concours :
Tours
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FICHE DE PROFIL || concours EXTERNES INRA 2009 :::::::
L'assistant en techniques biologiques met en oeuvre des techniques spécialisées pour l'obtention et l'étude d'échantillons biologiques.
....................................................................................................................................................................................................... n°BAP : A | Sciences du vivant Département : Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage unité n° 0083 URA | Recherches Avicoles Lieu de travail (si différent) :
personne(s) à contacter :
Yves NYS
02 47 42 72 82
[email protected]
Michel DUCLOS
02 47 42 78 43
[email protected]
....................................................................................................................................................................................................... Environnement : L'assistant(e) sera intégré au sein de l'unité de Recherche Avicoles (URA 83) dont l'objectif principal est d'évaluer et de proposer aux acteurs des filières avicoles, des stratégies innovantes adaptant les systèmes d'élevage et les génotypes pour améliorer la qualité et la diversité des produits. Il(elle) rejoindra l'équipe Fonction et Régulation des Protéines de l'oeuf (FRPO) qui a pour objectif de caractériser fonctionnellement les protéines de l'oeuf. Cette équipe se compose de 7 permanents dont 5 chercheurs ou ingénieurs. Il(elle) participera aussi, dans son champ d'expertise, au programme de l'équipe Croissance et Métabolisme. L'assistant(e) conduira des expériences en biologie, dans les domaines de la biochimie des protéines (western blot, HPLC) et de la biologie cellulaire et moléculaire (RTPCR, clonage, annotation, prédiction de fonction) , basées en particulier sur le développement de micro-méthodes (enzymologie, Elisa), de modèles cellulaires ou techniques de transfection, d'interference ARN et de marquages métaboliques avec des molécules radiomarquées pour étudier le rôle de gènes candidats et vérifier la fonction prédite (bioinformatique) de leur protéine . La personne recrutée devra mettre en oeuvre les réglementations afférentes à ces techniques en terme de risque chimique et de radioprotection (il (elle) devra en particulier assurer le rôle de personne compétente en radioprotection pour l'unité). http://wcentre.tours.inra.fr/sra/
Activités : Conduire dans le cadre d'un programme expérimental, un ensemble de techniques de biologie (cultures cellulaires, dosages biologiques et/ou biochimiques, techniques histologiques, immunologiques, biochimiques et de biologie moléculaire) Suivre les évolutions techniques du domaine et participer au développement de nouveaux protocoles Consigner, mettre en forme les résultats Communiquer les données expérimentales Mettre en oeuvre, faire appliquer et former aux réglementations liées aux activités expérimentales, se tenir informé de leurs évolutions Prélever et conditionner des échantillons en vue d'une expérimentation Gérer des bases de données et/ou des banques d'échantillons Assurer la gestion des stocks et des commandes et l'achat du petit appareillage Surveiller les installations, assurer l'entretien et la maintenance de premier niveau des installations et du matériel Initier les utilisateurs aux techniques du domaine Etablir le planning d'utilisation des équipements ou salles spécifiques Assurer la liaison entre l'équipe pédagogique et les étudiants ou visiteurs Contrôler l'élimination des déchets solides et des effluents selon les règles d'hygiène et de sécurité du domaine
Compétences :
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09/11/2009
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Connaissance générale de la biologie Notions de base en mathématiques, statistiques, physique et chimie Connaître les règles d'hygiène et de sécurité liées à la manipulation des produits toxiques, des produits contaminants et des organismes transgéniques (OGM) Connaître le domaine scientifique de la structure Maîtriser les techniques de biologie du domaine expérimental Connaître les principes et utiliser des appareils spécifiques du domaine : microscopes, séquenceurs, trieurs de cellules Utiliser l'outil informatique d'enregistrement des données et de pilotage d'appareils Communiquer et gérer les relations avec les interlocuteurs internes ou externes Rédiger des procédures techniques Comprendre l'anglais oral. Maîtriser l'anglais écrit Transmettre des savoir-faire techniques Maîtriser les conditions de conservation des échantillons biologiques Utiliser des logiciels de gestion des plannings, des stocks et commandes Travailler en milieu confiné ou en zone protégée
Capacités personnelles : BTS, DUT, DEUST Biochimie cellulaire et biologie moléculaire, biologie animale (physiologie) Expérience en expérimentation animale. 2009 | conception et réalisation : DRH - DSI
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09/11/2009
République Française
Centre de TOURS
CONCOURS EXTERNE AIA04 ASSISTANT INGENIEUR Assistant en techniques biologiques
EPREUVE ECRITE D’ADMISSIBILITE : le 2 juin 2009 DUREE : 3 heures - COEFFICIENT : 3 Recommandations : Vous devez répondre directement sur ce questionnaire en laissant une marge de 2 cm à droite et à gauche et en reportant le numéro des questions. L’épreuve étant anonyme, n’inscrivez ni votre nom, ni aucun signe distinctif sur ce questionnaire. Au cours de l'épreuve, les téléphones, les ordinateurs portables et les documents personnels sont interdits. La calculatrice et le dictionnaire sont autorisés. A la fin de l’épreuve, insérez votre questionnaire dans la copie qui porte vos coordonnées cachetées. Le sujet comporte 16 pages (page de garde incluse). L’orthographe et la qualité de la présentation seront prises en compte lors de la notation
----------------------------------------------------------------------------------------------------------------Etablissement public à caractère scientifique et technologique placé sous la tutelle conjointe des Ministres chargés de la Recherche et de l’Agriculture
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Questions QCM 30 minutes, 30 points 1 Un ARN messager eucaryote mature typique est composé de : A- un ou plusieurs introns B- un ou plusieurs exons C- une queue poly-A D- séquences UTR en 5’ et 3’
2 Une transcriptase réverse : A- a une activité ADN polymérase B- a une activité ARN polymérase C- a une activité 3’-5’ polymérase D- ne nécessite pas d’amorce oligonucléotidique
3 La température de fusion (Tm) d’un fragment d’ADN dépend de : A- la longueur du fragment B- de sa composition en bases C- de la force ionique du milieu D- de la présence de mésappariements
4 Un fragment d’ADN est amplifié par PCR à raison d’une vingtaine de cycles. En supposant qu’une seule copie de la région concernée soit présente dans le tube placé dans le thermocycleur et que l’efficacité de la PCR soit de 100%, combien de copies obtiendrez-vous en fin d’expérience? A- de l’ordre de 103 B- de l’ordre de 106 C- de l’ordre de 109 D- de l’ordre de 1012 5 Une nanomole c’est : A- 10-6 M B- 10-9 M C- 10-12 M D- 10-15 M 6 La longueur d’onde de 210nm se trouve dans : A- le visible B- les rayons X C- l’ultraviolet D- l’infrarouge 7 Les cellules souches embryonnaires de souris : A- sont des cellules totipotentes B- ont une croissance limitée en culture C- peuvent être modifiées génétiquement par transfection D- permettent l’obtention de souris transgéniques
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8 Entourez l’intrus : A- laminine B- fibronectine C- collagène D-digitonine 9 Entourez l’intrus : A-DTT B-PMSF C-β-mercaptoéthanol D-TBP 10 Entourez l’intrus : A- Thiourée B- Triton X114 C- SDS D- Tween 80 11 Le logiciel ClustalW permet de: A- de déterminer la présence et la position d’ORFs potentielles dans une séquence ADN B- aligner des séquences ADN C- aligner des séquences protéiques D- déterminer la position d’un peptide signal dans une séquence protéique 12 L’autre nom de « la mort cellulaire programmée » est : A- La nécrose B- La fibrose C- L’apoptose D- La thrombocytose 13 Quel est le fixateur possible pour une réaction immuno-histochimique : A- Le formaldéhyde B- Le glutaraldéhyde C- Le sucrose D- Le chlorure de sodium 14 Le pouvoir tampon d’une solution permet : A- d’augmenter la viscosité d’une solution B- d’augmenter la force ionique d’une solution C- de stabiliser le pH d’une solution D- de diminuer son absorbance 15 Pour réaliser un marquage d’épitope, quel type de traitement pouvez-vous effectuer ? A- Ammoniaque B- Citrate et chaleur C- Nucléase D- Xylène
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16 Sélectionnez les propositions exactes : A- Les protéines sont des polymères d’acides aminés B- Les protéines peuvent se lier à d’autres molécules C- Les oligopeptides sont constitués d’un grand nombre d’acides aminés D- La séquence en acides aminés d’une protéine peut influencer sa forme tridimensionnelle E- Les protéines sont toujours insolubles dans l’eau 17 Sélectionnez les propositions exactes. Le cahier de laboratoire : A- doit contenir tous les éléments nécessaires à la réalisation de l’expérience B- doit seulement contenir les résultats des expériences C- peut être raturé D- contient seulement le résumé des expériences réussies 18 Qui désigne la personne compétente en radioprotection ? A- L’Autorité de Sûreté Nucléaire B- Le chef d’établissement C- L’Institut de Radioprotection et de Sûreté Nucléaire D- Le Commissariat à l’Energie Atomique E- Le médecin du travail 19 Quel isotope nécessite un écran de10 mm de plexiglas pour se protéger ? A- H3 B- S35 C- Ca45 D- C14 E- P32 20 Votre collègue est victime d’un accident du travail, qui faites-vous prévenir en premier ? A- Le médecin du travail B- Le directeur du labo C- L’accueil D- Le sauveteur secouriste E- Le 15
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QUESTIONS COURTES 50 minutes, 50 points 21 Décrivez le principe de l’électrophorèse SDS-PAGE
22 Décrivez le principe de la chromatographie d’échange d’ions
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23 Décrivez le principe de la chromatographie de phase réverse
24 Citez 2 techniques permettant de mettre en évidence l’interaction entre 2 protéines. Décrivez brièvement le principe de l’une d’entre elles.
25 Citez 2 techniques permettant de concentrer une solution protéique.
26 Citez 2 souches d’Escherichia coli couramment utilisées en biologie moléculaire.
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27 Décrire brièvement le principe de l’interférence d’ARN (RNAi).
28 La culture de cellules nécessite la présence d’un milieu de culture tamponné et l’incubation de celles-ci à 37°C dans une étuve avec une atmosphère à 5 % de CO2 et saturée en humidité. Expliquez brièvement pourquoi.
29 Qu’appelle-t-on une culture primaire ?
30 Quelle est la différence entre des anticorps monoclonaux et polyclonaux ?
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31 Que représentent les branches d’un arbre phylogénétique ?
32 On vous demande de faire une recherche bibliographique, quel site internet allez vous utiliser de préférence?
33 Indiquez les risques associés pour chacun des pictogrammes ci-dessous ? A B
C
D
F
E
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A B C D E F
34 Quelle(s) protection(s) personnelle(s) utiliserez vous pour manipuler de l’acide sulfurique ?
35 À quelle température et pendant combien de temps dure la stérilisation d’un flacon d’eau nécessaire à la fabrication d’un milieu de culture ? 100 °C 121 °C 134 °C 180 °C
20 minutes 90 à 120 minutes 12 heures 24 heures
36 Citez cinq missions ou tâches essentielles de la Personne Compétente en Radioprotection -
37 Citez cinq pratiques entrant dans la mise en oeuvre d’une démarche d’assurance qualité -
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Exercices rapides 50 minutes, 50 points 38 Préparation d’une solution tampon. Vous voulez préparer 500ml d’une solution finale Tris-HCl 5mM, NaCl 0,1M, MnCl2 1mM, albumine 0,1%, pH 7,80. Vous disposez de : - NaCl pur en poudre dans un flacon (MM58,44) - Albumine en poudre dans un flacon - 50ml de MnCl2 en solution à 0,1M - 300 ml de Tris-HCl 20 mM pH 7,80 Présentez votre protocole clairement, n’hésitez pas à poser vos calculs.
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39 Vous avez cloné la séquence codante d’une protéine dans un plasmide pour l’exprimer chez Escherichia coli afin d’en obtenir suffisamment pour réaliser toute une série de tests biologiques. Après sélection de quelques transformants et avant d’entreprendre l’étape de production, vous avez fait séquencer la région contenant l’insert d’un de ces clones. Après analyse du résultat de la séquence, vous constatez la présence d’une mutation ponctuelle au sein de la séquence codante clonée. 1- Quelle base de données avez-vous consulté pour obtenir la séquence codante de la protéine avant le clonage? 2- Comment avez-vous procédé pour détecter les transformants? 3- Quelle analyse in silico vous a permis de mettre en évidence la mutation ponctuelle dans la séquence fournie par votre prestataire de séquençage? 4- Quelles peuvent être les conséquences d’une telle mutation ponctuelle? Quel type de logiciel peut être utilisé pour évaluer ces conséquences in silico ?
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40 Votre laboratoire doit développer des anticorps pour étudier une protéine impliquée dans le système immunitaire par immunohistochimie. Aucun anticorps dirigé contre cette protéine n’étant commercialisé, vous avez décidé de la produire par génie génétique chez Escherichia coli. Malheureusement, en raison de problèmes de solubilité et de purification, la quantité de protéine obtenue est insuffisante pour entreprendre l’immunisation de lapins et de souris. 1) Quelle autre stratégie que l’utilisation de la protéine purifiée peut être envisagée pour immuniser les animaux et obtenir des anticorps dans un délai raisonnable? 2) Pour évaluer la réponse en anticorps développés par les animaux que vous avez immunisés avec la stratégie que vous avez proposée précédemment, vous réalisez un ELISA indirect grâce à la petite quantité de protéine purifiée dont vous disposez. Citez les différentes étapes de l’ELISA indirect.
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41 Afin de développer une méthode de PCR Quantitative, vous avez préparé des plasmides contenant la séquence d’intérêt pour élaborer une gamme étalon et ainsi déterminer le nombre de copies du gène recherché. Sachant que la pureté de votre préparation plasmidique est satisfaisante, que son absorbance à 260 nm est de 2,3 et que la taille du plasmide est de 3485 paires de bases, calculez le nombre de copies du plasmide par microlitre de préparation. Il est rappelé que le MW moyen d’un ADN double brin est de 660 daltons par paire de bases. Nombre d’Avogadro : 1M= 6 x 1023 molécules
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42 La figure suivante représente le résultat d’une expérience de Southern réalisée avec une sonde de 800 paires de bases et le matériel génétique d’un organisme sauvage et de 2 mutants. 1) Citez les principales étapes nécessaires à la réalisation de cette expérience 2) Quel type de mutation affecte le mutant 1? 3) Quel type de mutation affecte le mutant 2? 4) Indiquer la nature de chacun des sites de restriction A, B, C, D et E (site EcoRI ou HindIII).
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Analyse d’une publication : 50 minutes, 50 points 43 Voici un extrait d’article publié en 2008. Après lecture répondez aux trois questions suivantes : 1) Quels sont le contexte scientifique et les objectifs de l’étude ? (10 lignes) 2) Décrivez les techniques mises en jeu afin d’obtenir les résultats de la figure 6 (10-15 lignes) 3) Quelles expériences complémentaires pourraient être envisagées pour compléter ces résultats ? (10 lignes) Ewe = brebis
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CONCOURS EXTERNE 2009 AIA04 "ASSISTANT EN TECHNIQUES BIOLOGIQUES" ASSISTANT INGENIEUR AUDITION Les 22 et 23 juin 2009.
COEFFICIENT 3 Préparation : 15mn Epreuve orale : 25 mn Exposé : 5 mn inclus dans la durée de l'épreuve
Sujet :
Pouvez-vous nous présenter une expérience ou expérimentation qui vous a particulièrement intéressé ?
