hrpZ : Nucleotide based phylogenetic tree HrpZ : Amino-acid ... - PLOS

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Group 4. P.s.tagetis_LMG5090. P.s.actinidiae_KW1. P.s.theae_tea632. P.s.magnoliae_PMG8101. P.s.morsprunorum_M302280PT. P.s.delphinii_PDDCC529.
P.s.myricae_yamamo801

P.sav.savastanoi_5

69

P.s.aesculi_NCPPB3681

P.s.morsprunorum_U7805

P.sav.fraxini_134

P.sav.fraxini_134 P.s.aesculi_NCPPB3681

P.sav.nerii_23 76

P.sav.savastanoi_NCPPB3335 63 88

P.s.myricae_yamamo801

P.s.dendropanacis_kakuremino-1

P.s.dendropanacis_kakuremino-1

P.sav.savastanoi_5

Group 3

P.s.eriobotryae_PERB8031 51 P.s.glycinea_S1

P.s.phaseolicola_KZ2W

P.s.glycinea_B076

P.s.phaseolicola_NPS3121

99 P.s.glycinea_r0 72

P.s.phaseolicola_1448A 10089

P.s.phaseolicola_KZ2W

P.s.glycinea_S1

46

P.s.phaseolicola_1448A

P.s.glycinea_B076 69

66 P.s.phaseolicola_NPS3121

P.s.glycinea_ro

P.s.syringae_KW741

40

P.s.syringae_KW741

63

66

P.s.oryzae_1_6

99 P.s.syringae_61

31 P.s.magnoliae_PMG8101

P.s.syringae_B728a P.s.aceris_M302273PT

100

100

P.s.theae_tea632

P.s.lapsa_NCPPB2096 46 98 P.s.pisi_race1 44

100

100

P.s.maculicola_M2

P.s.japonica_BPST802

99

100

71 P.s.tomato_T1

P.c.alisalensis_T3C P.c.alisalensis_ES4326 P.c.alisalensis_PSa866 P.c.alisalensis_BS91 P.c.alisalensis_PSa1_3 P.s.maculicola_R1

P.s.tomato_NCPPB1108 89

P.s.tomato_Max13

Group 5 100

P.s.lachrymans_M301315

98

P.s.lachrymans_CCM2857 P.s.lachrymans_Psl11

73

P.s.sesami_PSES-1

67

99

Group 3

96

P.s.mori_301020

P.s.oryzae_1_6 P.s.oryzae_1-1

100

90

Group 4

P.s.glycinea_Psg12

P.s.glycinea_A1

Group 3 Group 2 Group 3

P.s.pisi_Pisum-1 90

P.s.syringae_61 84 89 P.s.syringae_Ba728a

P.s.delphinii_PDDCC529

P.s.syringae_NV

Group 1

P.s.tomato_Max13

84

P.s.lapsa_NCPPB2096

93 P.s.pisi_race4 46

P.s.tomato_DC3000 52

Group 2

P.s.pisi_race1

P.s.maculicola_M2 85

44 P.s.lachrymans_M302278PT

P.s.aptata_SB8601

97 P.s.japonica_BPST802

P.s.tomato_NCPPB1108

P.cichorii_83-1

P.cichorii_83-1

HrpZ : Amino-acid based phylogenetic tree

Group 3

P.s.mori_301020

98 P.s.aceris_kaede1-1

70 P.s.tomato_T1

0.1

P.s.mori_mori1

P.s.actinidiae_KW1

P.s.morsprunorum_M302280PT

84

P.s.lachrymans_Psl11 P.s.lachrymans_CCM2857

P.s.tagetis_LMG5090

P.s.magnoliae_PMG8101

100

Group 5

47 P.s.sesami_PSES-1

100 P.s.theae_tea632 98

P.c.alisalensis_ES4326 P.s.maculicola_R1 P.c.alisalensis_T3C P.c.alisalensis_PSa866 P.c.alisalensis_BS91 P.c.alisalensis_PSa1_3

P.s.lachrymans_M301315 98

96 P.s.mori_mori1 100

Group 1

97 69 P.s.lachrymans_M302278PT

54

P.s.aptata_SB8601

99

P.s.delphinii_PDDCC529 P.s.tomato_DC3000

P.s.pisi_race4

54

P.s.morsprunorum_M302280PT P.s.actinidiae_KW11

Group 2

P.s.syringae_LOB2-1

91

Group 4

P.s.tagetis_LMG5090

P.s.aceris_kaede1-1 100

Group 2

P.s.oryzae_1-1

100

Group 3

68 P.s.glycinea_Psg12

95

Group 3

96 P.sav.savastanoi_NCPPB3335

P.s.eriobotryae_PERB8031 P.s.morsprunorum_U7805

84

P.sav.nerii_23

0.2

hrpZ : Nucleotide based phylogenetic tree

P.sav.savastanoi_ITM317 73 P.sav.nerii_23

P.cichorii_83-1 P.s.japonica_M301072PT

99

P.sav.savastanoi_5

99

P.sav.fraxini_134

P.s.aptata_DSM50252

100

61

Group 2

P.s.syringae_61 50

71

100

P.c.alisalensis_PSa1_3 P.c.alisalensis_T3C P.c.alisalensis_PSa866 P.c.alisalensis_ES4326 P.c.alisalensis_BS91 P.s.mori_301020

87

P.s.lachrymans_M301315

P.s.glycinea_PG4180 P.s.phaseolicola_1448A

Group 5

74

P.s.phaseolicola_NPS3121

100

P.s.glycinea_B076 P.s.lachrymans_M301315

Group 3 70

P.s.phaseolicola_NPS3121

87

62

78 P.s.phaseolicola_1448A

100

P.s.glycinea_race4 60 P.s.glycinea_B076

P.sav.nerii_23 P.s.aesculi_NCPPB3681 65

61

P.sav.savastanoi_5

P.s.japonica_M301072PT P.s.aptata_DSM50252

100

P.s.tagetis_LMG5090

68 P.s.tabaci_6605

P.s.oryzae_1_6

Group 4 80

P.s.tagetis_LMG5090 P.s.lachrymans_M302278PT

P.s.morsprunorum_M302280PT 95 P.s.tomato_DC3000 100

66 P.s.tomato_T1

P.s.tomato_K40 P.s.tomato_DC3000

Group 4

P.s.actinidiae_M302091

99

38

P.s.tomato_Max13

P.s.lachrymans_M302278PT P.s.tomato_T1

Group 1

100

P.s.tomato_NCPPB1108

100 P.s.tomato_NCPPB1108 P.s.actinidiae_M302091

92 P.s.tomato_K40

P.s.tomato_Max13

P.s.morsprunorum_M302280PT

P.viridiflava_PNA3.3a

P.viridiflava_PNA3.3a

0.05

Group 2

P.s.aceris_M302273PT

69

P.s.tabaci_ATCC11528

50

Group 5

P.s.syringae_Ba728a

100 100

10049 P.sav.savastanoi_NCPPB3335

100

P.c.alisalensis_PSa1_3 P.c.alisalensis_BS91 P.c.alisalensis_PSa866 P.c.alisalensis_T3C P.c.alisalensis_ES4326

P.s.syringae_61

Group 3

P.sav._fraxini_134

P.s.oryzae_1_6

Group 3

P.s.mori_301020

99

50

Group 3

100 97 P.s.tabaci_6605

96 P.s.aceris_M302273PT

97

P.s.aesculi_NCPPB3681 P.s.tabaci_ATCC11528

P.s.syringae_B728a

P.cichorii_83-1

HrcC : Amino-acid based phylogenetic tree 0.05

Figure S3

hrcC: Nucleotide based phylogenetic tree

Group 1