Supplementary Data Table S2

1 downloads 0 Views 143KB Size Report
espP. -. -. +. +. +. +. -. -. -. -. -. -. -. Long polar fimbriae. lpfAO113. +. +. +. +. +. +. -. -. -. -. -. +. +. lpfAO157. -. -. -. -. -. -. +. +. -. -. -. -. -. lpfAO26. ND. +. +. +. +. +.
Table S2: Virulence gene profile of E. coli isolated from water and sediment Sampled site

Selles Tourville Risle Water Sediment Water Sediment Water Sediment E. coli EC EC EC EC EC EC EC EC EC EC EC EC EC isolate 4199 6086 6089 6096 6111 6115 6230 6316 4312 4321 4330 6138 4342 Virulence gene stx1 + + + + stx1 + + + + VT1 + + + + stx2 + + stx2 + + VT2 + + stx2c-8 + + stx2dg + + stx2d2 + + stx2dglobal eae + + + + + + + + eae + + + + eae-beta + + eae-theta Serotype

wzxO174 wzxO81 H21 H25 aggR aatA aap pic set1

+

+

+

+

-

HPI

irp2 fyuA

Heatstable enterotox in OI-15 OI-43

EAEC

OI-43 / OI-48

OI-44 OI-50

OI-57

-

-

-

-

-

+ + + + +

-

-

-

-

-

-

+ +

+ +

+ +

+ +

-

-

+ +

+ +

astA

+

+

+

+

+

+

-

-

-

ehaA Z1151 Z1153 Z1155

+ -

+ -

+ + + +

+ + + +

+ + + +

+ + + +

+ -

+ -

Z1156 iha

+

+

+ +

+ +

+ +

+ +

-

terE ureD espV espK espN espX7 Z2096

-

-

+ + + + + + +

+ + + + + + +

+ + + + + + +

+ + + + + + +

+ -

-

-

-

-

+ + + + +

+ +

-

+ +

-

+

-

+

-

-

-

+ -

+ -

-

+

+ -

-

-

+

+ -

+ -

-

-

-

-

OI-71

OI-108 OI-122

pO157

Long polar fimbriae

Bundleforming pilus

Z2098 Z2099 Z2121 ecs1763 nleF nleG espM1 nleH1-2 nleA ecs1822 espM2 espW ent nleB nleE Z4331 efa1 efa2 ehxA ecf1 toxB katP espP lpfAO113

+

+

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +

+ + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +

+ + + + + + -

+ + + + + + -

-

-

+ -

+ + +

+

lpfAO157 lpfAO26 bfpA

ND -

+ -

+ -

+ -

+ -

+ -

+ -

+ -

-

-

-

+ +

-